PDF规范从1993年到现在，已经有过7个版本，六次版本升级，从最初的pdf1.0，版本到现在的PDF1.7, 每次的版本升级都会加入一些新的特性，PDF参考说明书也是从最初的100多页到现在的1000多页，但是PDF文件格式的主要特性还是没有改变，主要是随著Adobe Acrobat的新版本而更新的。以下为PDF文件的版本号，公布时间及Acrobat 版本号对应列表。
1993 – PDF 1.0 / Acrobat 1.0
1994 – PDF 1.1 / Acrobat 2.0 加入了文档加密（40字节），线索树，名字树，链接，设备独立色彩资源。
1996 – PDF 1.2 / Acrobat 3.0 表单, 半色调屏幕，和其他的一些高级色彩特性, 对中文，日文和韩文的支持
2000 – PDF 1.3 / Acrobat 4.0 数字签名, 逻辑结构， JavaScript, 嵌入式文件，Masked Images, 平滑阴影, 支持 CID字体的附加色彩。
2001 – PDF 1.4 / Acrobat 5.0 文件加密 (128 字节), 标签式 PDF, 访问控制，透明，元数据流
2003 – PDF 1.5 / Acrobat 6.0 文档加密 (公钥), JPEG 2000 压缩, 可选的内容组，附加的注解类型
2005 – PDF 1.6 / Acrobat 7.0 文档加密 (AES),增加最大文件支持，加入3D支持，额外的注解类型
2006 – PDF 1.7 / Acrobat 8.0 PDF包，自动识别表单域，管理共享审阅，存档 Microsoft Outlook 、Lotus Notes电子邮件，Microsoft Word格式保存，对 AutoCAD 的支持
2006 – PDF 1.7 / Acrobat 8.2
2008 – PDF 1.7, Adobe Extension Level 3 / Acrobat 9.0
2009 – PDF 1.7, Adobe Extension Level 5 / Acrobat 9.1
ISO标准ISO 32000-1:2008及Adobe PDF 1.7格式技术上是并存的。Adobe公司宣布以后不会再发布PDF 1.8格式。未来的PDF版本将由ISO技术协会提供。